Christophe Naudin est enseignant-chercheur en agronomie à l’ESA (Angers-49), partageant son temps entre enseignements, direction du programme ingénieur ESA (depuis 2018), et activités de recherche au sein de l’USC ESA-INRAE LEVA dans la continuité de son doctorat.

Il est membre du CA de l'AFA depuis 2020.